讲师:庞老师 资深生物信息分析工程师
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Linux简介
Linux安装
生信linux 常用命令手册(50个)
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1. ls [-alrtAFR] [name...]
2. mv [options] source dest/directory
3. cp [options] source dest/directory
4. rm [options] name...
5. touch [-acfm][-d<日期时间>][-r<参考文件或目录>] [-t<日期时间>][--help][--version][文件或目>录…]
6. pwd [--help][--version]
7. cd [dirName]
8. mkdir [-p] dirName
9. rmdir [-p] dirName
10. cat [-AbeEnstTuv] [--help] [--version] fileName
11. tac 反向显示
12. more [-dlfpcsu] [-num] [+/pattern] [+linenum] [fileNames..]
13. less [参数] 文件
14. head [参数]… [文件]… | 显示档案开头,默认开头10行
15. tail [必要参数] [选择参数] [文件] | 显示文件结尾内容
16. echo string
17. vi/vim 编辑文件
18. which [文件...]
19. locate [-d ][--help][--version][范本样式...]
20. cut [参数] [file]
21. ln [参数][源文件或目录][目标文件或目录]
22. tar -f[cxzjv]
23. zip [-1..9][-r]
24. gzip [-1..9][-r]
25. bzip2
26. sort [-bcdfimMnr][-o<输出文件>][-t<分隔字符>][+<起始栏位>-<结束栏位>][--help][--verison][文件]
27. uniq [-cdu][-f<栏位>][-s<字符位置>][-w<字符位置>][--help][--version][输入文件][输出文件]
28. wc [-clw][--help][--version][文件...]
29. grep [-abcEFGhHilLnqrsvVwxy][-A<显示列数>][-B<显示列数>][-C<显示列数>][-d<进行动作>][-e<范本样式>][-f<范本文件>][--help][范本样式][文件或目录...]
30. awk [-F] ‘(condition){operate}’
31. sed [-i] '{command}'
32. md5sum [-c]
33. chmod [-R]
34. find [path] [expression]
35. du [-ash] [--max-depth=]
36. ps [options] [--help]
37. top [-bcdu]
38. jobs [-l]
39. kill [-num] [-l]
40. fg [%num]
41. bg [%num]
42. history
43. nohup
44. 转后台 &
45. 重定向 >
46. 追加 >>
47. 管道符 |
48. finger [选项] [使用者] [用户@主机] | 查看用户信息
49. paste 合并文件,需确保合并的两文件行数相同
50. watch [参数] [命令] |重复执行某一命令以观察变化