老师寄语：
这一章我们学习生信编程之Perl基础，为什么我们要学习编程？大家都知道，我们生物信息分析师所处理的数据大部分是人工无法处理的，所以我们需要借助程序来帮助我们来处理这些非常庞大的数据。
本章课程的学习目标：让大家对Perl有一个简要的认识，知道什么是编程，知道编程能帮助我们做些什么，当你看到一个Perl程序的时候不会像看天书一样，至少能看懂其中某一部分，学的好的同学自己可以写一些小的程序。
讲师：庞老师 资深生物信息分析工程师
目录
Perl简介
Perl基本操作
Perl控制结构
Perl文件操作
Perl借用了C、sed、awk、shell脚本以及很多其他编程语言的特性，语法与这些语言有些类似，也有自己的特点。
Perl 语言没有严格的格式规范，你可以根据自己喜欢的风格来缩进。
第一个 perl 程序
你可以在命令行中使用 -e 选项来输入语句来执行代码，实例如下：
$ perl -e 'print "Hello World\n"'
脚本式编程
#!/usr/bin/perl print "Hello, world\n";
print 也可以使用括号来输出字符串，以下两个语句输出相同的结果：
print("Hello, world\n");
print "Hello, world\n";
脚本文件
文件名可以包含数字，符号和字母，但不能包含空格，可以使用下划线（_）来替代空格。
使用注释使你的程序易读，这是好的编程习惯。
perl 也支持多行注释，最常用的方法是使用 POD(Plain Old Documentations) 来进行多行注释。方法如下:
实例
Hello, world\n";
注意：
- =pod、 =cut只能在行首。
- 以=开头，以=cut结尾。
- =后面要紧接一个字符，=cut后面可以不用。
Perl 中的空白
#!/usr/bin/perl print "Hello, world\n";
但是如果空格和分行出现在字符串内，他会原样输出：
实例
Hello world\n";
所有类型的空白如：空格，tab ，空行等如果在引号外解释器会忽略它，如果在引号内会原样输出。
单引号和双引号
#!/usr/bin/perl print "Hello, world\n"; print 'Hello, world\n';
从结果中我们可以看出，双引号 \n 输出了换行，而单引号没有。
#!/usr/bin/perl $a = 10; print "a = $a\n"; print 'a = $a\n';
Here文档又称作heredoc、hereis、here-字串或here-脚本，是一种在命令行shell（如sh、csh、ksh、bash、PowerShell和zsh）和程序语言（像Perl、PHP、Python和Ruby）里定义一个字串的方法。
- 1.必须后接分号，否则编译通不过。
- 2.END可以用任意其它字符代替，只需保证结束标识与开始标识一致。
- 3.结束标识必须顶格独自占一行(即必须从行首开始，前后不能衔接任何空白和字符)。
- 4.开始标识可以不带引号号或带单双引号，不带引号与带双引号效果一致，解释内嵌的变量和转义符号，带单引号则不解释内嵌的变量和转义符号。
- 5.当内容需要内嵌引号（单引号或双引号）时，不需要加转义符，本身对单双引号转义，此处相当与q和qq的用法。
实例
EOF"; 这是一个 Here 文档实例，使用双引号。 可以在这输如字符串和变量。 例如：a = $a EOF print "$var\n"; $var = <<'EOF'; 这是一个 Here 文档实例，使用单引号。 例如：a = $a EOF print "$var\n";
<p style="border: 0px; margin: 0px; padding: 0px; line-height: 2em; word-wrap: break-word; word-break: break-all; font-family: " helvetica="" neue",="" helvetica,="" "pingfang="" sc",="" "hiragino="" sans="" gb",="" "microsoft="" yahei",="" "noto="" cjk="" "wenquanyi="" micro="" hei",="" arial,="" sans-serif;="" color:="" rgb(51,="" 51,="" 51);"="">执行以上程序输出结果为：
这是一个 Here 文档实例，使用双引号。
可以在这输如字符串和变量。
例如：a = 10
这是一个 Here 文档实例，使用单引号。
例如：a = $a
